Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKIDA1Q1XH10 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SKIDA1Q1XH10 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms