Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RTL8BQ17RB0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RTL8BQ17RB0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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