Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRNP35Q16560 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRNP35Q16560 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRNP35Q16560 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
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