Protein–RNA interactions for Protein: Q16540

MRPL23, 39S ribosomal protein L23, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL23Q16540 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MRPL23Q16540 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MRPL23Q16540 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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