Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VPS72Q15906 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
VPS72Q15906 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
VPS72Q15906 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
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