Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USF2Q15853 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
USF2Q15853 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USF2Q15853 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USF2Q15853 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
USF2Q15853 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USF2Q15853 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
USF2Q15853 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
USF2Q15853 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
USF2Q15853 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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