Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PUM3Q15397 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PUM3Q15397 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUM3Q15397 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUM3Q15397 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PUM3Q15397 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms