Protein–RNA interactions for Protein: Q15370

ELOB, Elongin-B, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOBQ15370 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ELOBQ15370 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ELOBQ15370 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms