Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF4Q15306 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IRF4Q15306 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms