Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
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RABEP1Q15276 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RABEP1Q15276 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
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RABEP1Q15276 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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RABEP1Q15276 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
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RABEP1Q15276 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
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RABEP1Q15276 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RABEP1Q15276 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
RABEP1Q15276 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
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