Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRAM2Q15035 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRAM2Q15035 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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