Protein–RNA interactions for Protein: Q15006

EMC2, ER membrane protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC2Q15006 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC2Q15006 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC2Q15006 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC2Q15006 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC2Q15006 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
EMC2Q15006 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
EMC2Q15006 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMC2Q15006 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMC2Q15006 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms