Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC37.26■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GAPVD1Q14C86 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC37.26■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GAPVD1Q14C86 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC37.2■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
GAPVD1Q14C86 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
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