Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
EIF3AQ14152 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
EIF3AQ14152 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
EIF3AQ14152 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
EIF3AQ14152 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EIF3AQ14152 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EIF3AQ14152 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
EIF3AQ14152 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
EIF3AQ14152 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
EIF3AQ14152 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms