Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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PDE6HQ13956 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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PDE6HQ13956 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
PDE6HQ13956 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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