Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
APOFQ13790 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOFQ13790 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOFQ13790 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOFQ13790 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOFQ13790 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOFQ13790 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOFQ13790 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
APOFQ13790 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
APOFQ13790 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
APOFQ13790 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
APOFQ13790 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
APOFQ13790 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
APOFQ13790 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
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