Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX1Q13596 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX1Q13596 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
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