Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IRF5Q13568 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IRF5Q13568 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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