Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
PKD2Q13563 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PKD2Q13563 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PKD2Q13563 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PKD2Q13563 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms