Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NEUROD1Q13562 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
NEUROD1Q13562 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
NEUROD1Q13562 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
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