Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C1orf61Q13536 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C1orf61Q13536 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms