Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
TCOF1Q13428 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC34■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
TCOF1Q13428 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
TCOF1Q13428 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
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