Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RPA4Q13156 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPA4Q13156 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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