Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRKAA1Q13131 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
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PRKAA1Q13131 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKAA1Q13131 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
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