Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHAF1BQ13112 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CHAF1BQ13112 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
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