Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHAF1AQ13111 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHAF1AQ13111 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHAF1AQ13111 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
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