Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRDNQ13061 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRDNQ13061 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TRDNQ13061 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms