Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
BNIP1Q12981 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNIP1Q12981 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
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