Protein–RNA interactions for Protein: Q12955

ANK3, Ankyrin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANK3Q12955 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANK3Q12955 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANK3Q12955 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANK3Q12955 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ANK3Q12955 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANK3Q12955 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANK3Q12955 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANK3Q12955 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ANK3Q12955 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms