Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NEXNQ0ZGT2 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NEXNQ0ZGT2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms