Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
RASGEF1BQ0VAM2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RASGEF1BQ0VAM2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms