Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCBP1Q09161 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NCBP1Q09161 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms