Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ACTN3Q08043 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ACTN3Q08043 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms