Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FMODQ06828 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FMODQ06828 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FMODQ06828 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FMODQ06828 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FMODQ06828 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
FMODQ06828 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
FMODQ06828 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
FMODQ06828 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
FMODQ06828 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
FMODQ06828 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
FMODQ06828 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
FMODQ06828 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms