Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
GABPB1Q06547 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GABPB1Q06547 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GABPB1Q06547 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms