Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RUNX1T1Q06455 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RUNX1T1Q06455 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms