Protein–RNA interactions for Protein: Q06141

REG3A, Regenerating islet-derived protein 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG3AQ06141 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
REG3AQ06141 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
REG3AQ06141 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms