Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC18A2Q05940 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC18A2Q05940 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC18A2Q05940 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms