Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTK2Q05397 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PTK2Q05397 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms