Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSTF1Q05048 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CSTF1Q05048 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CSTF1Q05048 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms