Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CENPEQ02224 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CENPEQ02224 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CENPEQ02224 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms