Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TNFRSF17Q02223 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TNFRSF17Q02223 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms