Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CDR2Q01850 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CDR2Q01850 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CDR2Q01850 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms