Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PRCDQ00LT1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PRCDQ00LT1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms