Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IRF9Q00978 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IRF9Q00978 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms