Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HSF1Q00613 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HSF1Q00613 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms