Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CDK6Q00534 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CDK6Q00534 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms