Protein–RNA interactions for Protein: Q00341

HDLBP, Vigilin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBPQ00341 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
HDLBPQ00341 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HDLBPQ00341 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms