Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITPNAQ00169 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PITPNAQ00169 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms