Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TFAMQ00059 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TFAMQ00059 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms